PMS2 టెస్టింగ్ సులువుగా
PMS2 టెస్ట్ ఎందుకు కష్టం: మిగతా జన్యువులకంటే వేరుగా ఉండే కారణం
PMS2 జన్యువులో ఒక భాగానికి దాదాపు అచ్చం అలాగే ఉండే నకలు మీ DNA లో దగ్గరలోనే ఉంటుంది. దాన్ని సూడోజీన్ అంటారు. అందుకే PMS2 ను టెస్ట్ చేయడం కష్టం. సాధారణ సీక్వెన్సింగ్ ఒకదాన్ని మరొకటిగా పొరబడవచ్చు. దాంతో తప్పుడు హెచ్చరిక రావచ్చు, లేదా నిజమైన లోపం కనిపించకుండా పోవచ్చు. జాగ్రత్తగా పనిచేసే ల్యాబ్లు ఈ రెండింటినీ వేరు చేయడానికి అదనపు తనిఖీలు చేస్తాయి. ఇది ఎందుకు జరుగుతుంది, మీ రిపోర్ట్లో ఏమి ఉండవచ్చు, ఏమి అడగాలి అనేది ఈ పేజీ వివరిస్తుంది.
ఈ పేజీలో
- PMS2 ను టెస్ట్ చేయడం మిగతా జన్యువుల కంటే ఎందుకు కష్టం?
- సూడోజీన్ వల్ల ఫలితం ఎలా తప్పుదారి పట్టవచ్చు?
- జాగ్రత్తగా పనిచేసే ల్యాబ్ PMS2 ను ఎలా టెస్ట్ చేస్తుంది?
- టెస్టింగ్లో వాడే ఈ పదాలకు అర్థం ఏమిటి?
- PMS2 రిపోర్ట్లో ఏమి ఉండవచ్చు, దానికి అర్థం ఏమిటి?
- PMS2 టెస్టుల గురించి చాలామంది తప్పుగా ఏమి అనుకుంటారు?
- ఈ పేజీ మీకు ఏమి చెప్పలేదు?
- PMS2 టెస్టింగ్ గురించి కుటుంబాలు అడిగే ప్రశ్నలు
సూటిగా సమాధానం
PMS2 ను టెస్ట్ చేయడం మిగతా జన్యువుల కంటే ఎందుకు కష్టం?
ఎందుకంటే మీ DNA లో PMS2 జన్యువు వెనుక భాగానికి దాదాపు అచ్చం అలాగే ఉండే ఒక నకలు ఉంటుంది. ఈ నకలును సూడోజీన్ (pseudogene) అంటారు, దాని పేరు PMS2CL. ఇది అదే క్రోమోజోమ్ మీద PMS2 కు దగ్గరలోనే ఉంటుంది, కానీ ఏ ఉపయోగకరమైన పనీ చేయదు. సాధారణ టెస్టులు DNA ను చిన్న చిన్న ముక్కలుగా చదువుతాయి. PMS2 లోని ఒక చిన్న ముక్క, దాని నకలులోని ముక్కలాగే సరిగ్గా కనిపించవచ్చు.
సూడోజీన్ అంటే ఏమిటి?
సూడోజీన్ అంటే ఒక నిజమైన జన్యువుకు చెందిన పాత, పాడైపోయిన నకలు. అది చాలా కాలం క్రితమే పనిచేయడం మానేసింది, కానీ దాని "స్పెల్లింగ్" ఇప్పటికీ దాదాపు అలాగే ఉంటుంది. క్యాన్సర్ రిస్క్ కోసం టెస్ట్ చేసే చాలా జన్యువులకు ఇలాంటి నకలు ఉండదు. PMS2 కు మాత్రం ఉంది. టెస్టింగ్లో వచ్చే కష్టంలో ఎక్కువభాగాన్ని ఈ ఒక్క విషయమే వివరిస్తుంది.
రెండింటి స్పెల్లింగ్ ఎందుకు కలగలిసిపోతుంది?
జన్యువు, దాని నకలు అప్పుడప్పుడు DNA లోని కొన్ని భాగాలను ఒకదానితో ఒకటి మార్చుకుంటాయి. దీన్ని జీన్ కన్వర్షన్ (gene conversion) అంటారు. కాబట్టి మామూలుగా ఆ రెండింటినీ వేరు చేసి చూపే కొద్దిపాటి అక్షరాలు కూడా ఒకదాని నుంచి మరొకదానికి మారిపోవచ్చు. తాను చదువుతున్నది అసలు జన్యువా, నకలా అని నిర్ణయించడానికి ల్యాబ్ ఆ అక్షరాల మీద మాత్రమే ఆధారపడలేదు.
ఈ కష్టం సాంకేతికమైనది, వైద్యపరమైనది కాదు. దీని వల్ల PMS2 లోపం మరింత ప్రమాదకరంగా మారదు.ఎక్కడ పొరపాటు జరుగుతుంది
సూడోజీన్ వల్ల ఫలితం ఎలా తప్పుదారి పట్టవచ్చు?
నకలు ఒక టెస్ట్ను నాలుగు రకాలుగా తప్పుదోవ పట్టించవచ్చు. జాగ్రత్తగా పనిచేసే ల్యాబ్ ఈ ప్రతి ఒక్కదాని నుంచీ కాపాడుకుంటుంది.
తప్పుడు హెచ్చరిక
నిజానికి హాని లేని నకలులో ఉన్న మార్పును, అది PMS2 లోనే ఉన్నట్టు రిపోర్ట్ చేయవచ్చు. అప్పుడు ఆ వ్యక్తికి లించ్ సిండ్రోమ్ లేకపోయినా, ఉండవచ్చని చెబుతారు.
కనిపించకుండా పోయిన లోపం
PMS2 లోని నిజమైన లోపం కూడా దాగిపోవచ్చు — టెస్ట్ అది ఎక్కడ ఉందో గుర్తించలేకపోవడం వల్ల గానీ, ఆ భాగాన్ని అసలు టెస్ట్లో చేర్చకపోవడం వల్ల గానీ. కొన్ని పాత ప్యానెల్స్ జన్యువులోని ఆ ప్రభావిత భాగాన్ని పూర్తిగా కవర్ చేయలేదు.
టెస్ట్ జన్యువులో ఎంత భాగాన్ని చదవగలిగిందో, నెగటివ్ ఫలితం కూడా అంత వరకే నమ్మదగినది.ఎక్కడిదో తేల్చలేని డిలీషన్
DNA లో కొన్ని ముక్కలు పూర్తిగా లేకపోవడం (deletion) PMS2 లోపాల్లో తరచుగా కనిపించే రకం. సాధారణ డిలీషన్ టెస్టులు ఏదో భాగం లేదని చూడగలవు, కానీ ఆ భాగం ఏ కాపీ నుంచి పోయిందో ప్రతిసారీ చెప్పలేవు.
స్పష్టత లేని రిపోర్ట్
మార్పు PMS2 లో ఉందో దాని నకలులో ఉందో తేల్చలేకపోయామని కొన్ని రిపోర్టులు చెబుతాయి. అది నిజాయితీతో ఇచ్చిన సమాధానం, ఫలితం కాదు.
తర్వాత ఏమి కావాలి
- నిర్ధారించడానికి మరో పద్ధతి
- అందుబాటులో ఉంటే, కణితి స్టెయిన్ ఫలితాలు
- ప్లాన్ను వివరించడానికి ఒక జెనెటిక్ కౌన్సెలర్
ఇది మీకు వర్తిస్తుందో లేదో తెలియడం లేదా?
ఆంకాలజిస్ట్ను అడగండిఫలితాన్ని సరిగ్గా తనిఖీ చేయడం
జాగ్రత్తగా పనిచేసే ల్యాబ్ PMS2 ను ఎలా టెస్ట్ చేస్తుంది?
సాధారణ జీన్ ప్యానెల్తో మొదలు
చాలా టెస్టింగ్ ఒకేసారి చాలా జన్యువులను చదివే ప్యానెల్తో మొదలవుతుంది. ఇది వేగంగా జరుగుతుంది, PMS2 లో ఎక్కువభాగాన్ని బాగానే కవర్ చేస్తుంది. కానీ జన్యువు వెనుక భాగం సంగతిని ఇది ఒక్కటే తేల్చలేదు.
రెండూ ఒకేలా ఉండే భాగంలో ఏది కనిపించినా గుర్తుపెట్టడం
PMS2, దాని నకలు ఒకేలా కనిపించే చోట ఏ మార్పు దొరికినా, దాన్ని మళ్లీ పరిశీలించాల్సినదిగా గుర్తుపెడతారు. దాన్ని వెంటనే పాజిటివ్ ఫలితంగా రిపోర్ట్ చేయరు.
పొడవైన రీడ్తో నిర్ధారణ
లాంగ్-రేంజ్ PCR (long-range PCR) అనే పద్ధతి, PMS2 కు మాత్రమే ఉండే ఒక భాగం నుంచి మొదలయ్యే ఒక పొడవైన DNA భాగాన్ని కాపీ చేస్తుంది. ఆ భాగం లోపల ఏది దొరికినా అది నిజమైన జన్యువుకే చెందుతుంది, నకలుకు కాదు.
నిర్ధారించినదాన్ని మాత్రమే రిపోర్ట్ చేయడం
మార్పు PMS2 లో ఉందో లేదో తుది రిపోర్ట్ స్పష్టంగా చెప్పాలి. అది ఎక్కడ ఉందో తేల్చలేకపోతే, ఊహించి చెప్పకుండా అదే విషయాన్ని రిపోర్ట్ చెప్పాలి.
మీ రిపోర్ట్లో
టెస్టింగ్లో వాడే ఈ పదాలకు అర్థం ఏమిటి?
- సూడోజీన్ (Pseudogene)
- దాదాపు అదే స్పెల్లింగ్ ఉండే, పనిచేయని జన్యువు నకలు. PMS2 విషయంలో ముఖ్యమైనదాని పేరు PMS2CL.
- జీన్ కన్వర్షన్ (Gene conversion)
- ఒక జన్యువు, దాని నకలు మధ్య DNA భాగాలు అటూ ఇటూ మారడం. మామూలుగా ఆ రెండింటినీ వేరుగా చూపే అక్షరాలను ఇది అస్పష్టం చేస్తుంది.
- నెక్స్ట్-జనరేషన్ సీక్వెన్సింగ్ (NGS)
- DNA ను ఒకేసారి చాలా చిన్న ముక్కలుగా చదివే సాధారణ పద్ధతి. వేగంగా జరుగుతుంది, కానీ చిన్న ముక్కలు ఎక్కడివో ప్రతిసారీ తేల్చలేము.
- లాంగ్-రేంజ్ PCR (Long-range PCR)
- PMS2 మాత్రమే ఉండే చోట నుంచి మొదలుపెట్టి ఒక పొడవైన DNA భాగాన్ని కాపీ చేసే విధానం. దీంతో నకలు కలవకుండా అసలు జన్యువును మాత్రమే చదవవచ్చు.
- MLPA
- జన్యువులో ఏవైనా ముక్కలు లేకపోయినా, అదనంగా ఉన్నా గుర్తించే టెస్ట్. PMS2 విషయంలో దీని ఫలితాన్ని చాలా జాగ్రత్తగా అర్థం చేసుకోవాలి.
- అర్థం ఇంకా తేలని మార్పు (VUS)
- హానికరమో హాని లేనిదో ల్యాబ్ ఇంకా చెప్పలేని మార్పు. దీని వల్ల మీ సంరక్షణ ప్లాన్ మారకూడదు.
మీ నంబర్ ఇవ్వండి, మేమే కాల్ చేస్తాం
ఒక్క నంబర్ చాలు. పెద్ద ఫారం లేదు, ఈ కాల్కు ఎలాంటి ఛార్జీ లేదు.
రిపోర్ట్ను చదవడం
PMS2 రిపోర్ట్లో ఏమి ఉండవచ్చు, దానికి అర్థం ఏమిటి?
సాధారణ నమ్మకాలు
PMS2 టెస్టుల గురించి చాలామంది తప్పుగా ఏమి అనుకుంటారు?
అది టెస్ట్ పద్ధతి మీద ఆధారపడుతుంది. జన్యువు వెనుక భాగాన్ని టెస్ట్ సరిగా చదవలేకపోతే, నిజమైన లోపం కనిపించకుండా పోయి ఉండవచ్చు. జన్యువు మొత్తం కవర్ అయిందో లేదో మీ కౌన్సెలర్ను అడగండి.
ఆ మార్పు నిజమైన జన్యువులోనే ఉందని నిర్ధారించి, అది హానికరమైనదిగా వర్గీకరించినప్పుడు మాత్రమే అలా అనుకోవచ్చు. ఇటీవలి ఒక అధ్యయనంలో, రెండూ ఒకేలా ఉండే భాగంలో లోపాలుగా కనిపించిన చాలా మార్పులు, లాంగ్-రేంజ్ PCR తో తనిఖీ చేసినప్పుడు నిర్ధారణ కాలేదు.
సూడోజీన్ను ఎలా సంభాళిస్తాయి అనే విషయంలో ప్యానెల్స్ వేర్వేరుగా ఉంటాయి. ఏ పద్ధతి వాడారో ధరను చూసి తెలుసుకోలేరు. రెండూ ఒకేలా ఉండే భాగంలోని మార్పులను తాము ఎలా నిర్ధారిస్తామో నమ్మదగిన ల్యాబ్ మీకు వివరించాలి.
నిర్ధారించిన ఫలితం నమ్మదగినదే. కష్టమంతా నిర్ధారణ వరకు చేరుకోవడంలోనే ఉంది — దానికి అదనపు దశలు, కొన్నిసార్లు అదనపు సమయం పడుతుంది. అది పూర్తయ్యాక, సమాధానం మిగతా ఏ జన్యువుకైనా ఉన్నంత స్థిరంగానే ఉంటుంది.
మీతో సూటిగా
ఈ పేజీ మీకు ఏమి చెప్పలేదు?
మీ సొంత టెస్ట్ సరిగ్గా జరిగిందో లేదో, లేదా గుర్తుపెట్టిన మార్పు నిజమైనదో కాదో ఈ పేజీ చెప్పలేదు. అది ల్యాబ్ పద్ధతి మీద ఆధారపడుతుంది. ఆ పద్ధతి గురించి సాధారణంగా రిపోర్ట్లోని చిన్న అక్షరాల్లో రాసి ఉంటుంది. మీ ప్రత్యేక వేరియంట్కు అర్థం ఏమిటి అనేది, ఆ టెస్ట్ చేయించిన జెనెటిక్ కౌన్సెలర్ను అడగాల్సిన ప్రశ్న.
మళ్లీ ఒకసారి చూడమని ఎప్పుడు అడగడం మంచిది?
కుటుంబ చరిత్ర లించ్ సిండ్రోమ్ను బలంగా సూచిస్తూ, కణితి స్టెయిన్లో PMS2 కనిపించలేదని తేలి ఉంటే, రక్త పరీక్ష నెగటివ్ వచ్చినా దాని గురించి మరోసారి మాట్లాడడం అవసరం. టెస్ట్ జన్యువును పూర్తిగా కవర్ చేసిందో లేదో, వేరే పద్ధతి అవసరమో లేదో మీ కౌన్సెలర్ చూడగలరు.
ఇది ఎవరికి వర్తించదు?
ఇది చదువుతున్న చాలామంది సూడోజీన్ల గురించి ఆందోళన పడాల్సిన అవసరం లేదు. మీరు ఇంకా టెస్ట్ చేయించుకోకపోయినా, లేదా మీ టెస్ట్ వేరే జన్యువు కోసం జరిగినా, ఇందులోని ఏ విషయమూ మీకు వర్తించదు. క్యాన్సర్ మందును ఎంచుకోవడానికి చేసే కణితి టెస్టులు వేరే ప్రశ్నకు సమాధానం ఇస్తాయి. వాటి గురించి టార్గెటెడ్ థెరపీ పేజీల్లో వివరించాం.
తరచుగా అడిగే ప్రశ్నలు
PMS2 టెస్టింగ్ గురించి కుటుంబాలు అడిగే ప్రశ్నలు
PMS2CL అంటే ఏమిటి?
అదే సూడోజీన్ — PMS2 వెనుక భాగానికి పనిచేయని నకలు. ఇది అదే క్రోమోజోమ్ మీద దగ్గరలోనే ఉంటుంది. కణంలో దీనికి ఏ పనీ లేదు. ఇది PMS2 లాగే చాలా దగ్గరగా కనిపించడం వల్ల టెస్టులు ఈ రెండింటి మధ్య తికమకపడవచ్చు. ఇది ముఖ్యమైనది ఆ ఒక్క కారణంతోనే.
సూడోజీన్ స్వయంగా క్యాన్సర్ను కలిగించగలదా?
లేదు. ఇది పనిచేసే జన్యువు కాదు. దీనిలోని మార్పులు క్యాన్సర్ రిస్క్ పెంచుతాయని ఇప్పటివరకు తెలియదు. ఉన్న ఒకే ఒక సమస్య ఏమిటంటే, నకలులోని మార్పును అసలు జన్యువులోని మార్పుగా పొరబడే అవకాశం ఉంది. అందుకే నిర్ధారణ ముఖ్యం.
కొన్ని PMS2 రిపోర్టులకు ఎందుకు ఎక్కువ సమయం పడుతుంది?
రెండూ ఒకేలా ఉండే భాగంలో మార్పు కనిపించినప్పుడు, అది ఎక్కడ ఉందో నిర్ధారించడానికి ల్యాబ్ మరో, మరింత జాగ్రత్తైన పద్ధతిని నడుపుతుంది. ఆ అదనపు దశ వల్ల సమయం పెరుగుతుంది. అది మంచి పద్ధతికి గుర్తు, మీ శాంపిల్లో సమస్య ఉందని కాదు.
పాత PMS2 టెస్ట్ను మళ్లీ చేయించుకోవాలా?
కొన్నిసార్లు. మీ టెస్ట్ కొంత కాలం క్రితం జరిగి, మీ కుటుంబ చరిత్ర లేదా కణితి స్టెయిన్ PMS2 వైపు చూపిస్తుంటే, ఆ పద్ధతి జన్యువు మొత్తాన్ని కవర్ చేసిందో లేదో మీ కౌన్సెలర్ను అడగండి. ముందు ఆ ప్రశ్నకు సమాధానం తెలుసుకోకుండా టెస్ట్ను మళ్లీ చేయించడం వల్ల ఉపయోగం అరుదుగానే ఉంటుంది.
కణితి స్టెయిన్ ఏమైనా సహాయపడుతుందా?
అవును. ఒక బంధువు కణితి స్టెయిన్లో PMS2 ఒక్కటే కనిపించలేదని తేలితే, అది రక్త పరీక్షను PMS2 వైపు మళ్లిస్తుంది, ఎక్కడ మరింత జాగ్రత్తగా చూడాలో ల్యాబ్కు చెబుతుంది. రక్త పరీక్ష నెగటివ్ వచ్చినా, విషయాన్ని త్వరగా ముగించేయకుండా దాన్ని ప్రశ్నించడానికి కౌన్సెలర్కు బలమైన కారణం కూడా ఇస్తుంది.
ఇదే సమస్య నా బంధువుల టెస్టులపై కూడా ఉంటుందా?
అంతగా ఉండదు. కుటుంబంలో ఒకరిలో లోపం నిర్ధారణ అయ్యాక, బంధువులకు సరిగ్గా అదే మార్పు కోసం టెస్ట్ చేస్తారు — సాధారణంగా మొదటి నుంచే నిర్ధారించే పద్ధతితో. దాంతో బంధువులకు చేసే టెస్టింగ్, కుటుంబంలో మొదటిసారి చేసిన టెస్ట్ కంటే సూటిగా ఉంటుంది.
PMS2 టెస్టింగ్కు ఖర్చు ఎక్కువ అవుతుందా?
నిర్ధారణ అవసరమైనప్పుడు అదనపు పద్ధతి నడపాల్సి వస్తుంది కాబట్టి, ఖర్చు పెరగవచ్చు. మీకు చెప్పిన ధరలో ఆ నిర్ధారణ కూడా కలిసి ఉందో లేదో టెస్టింగ్కు ముందే ల్యాబ్ను అడగండి. దాంతో తర్వాత ఏ ఆశ్చర్యమూ ఉండదు.
నా రిపోర్ట్లో "తేలలేదు" (unresolved) అని ఉంటే ఎక్కడ మొదలుపెట్టాలి?
టెస్ట్ చేయించిన కౌన్సెలర్ దగ్గరికి రిపోర్ట్ను తీసుకెళ్లి, తర్వాత ఏ టెస్ట్ ప్లాన్ చేస్తున్నారో అడగండి. బంధువుల కణితి స్టెయిన్ ఫలితాలు ఏవైనా ఉంటే వాటిని కూడా తీసుకురండి. ఎవరిని కలవాలో తెలియకపోతే CION హెల్ప్లైన్కు ఫోన్ చేయండి. సరైన క్లినిక్ వైపు ఎవరో ఒకరు మీకు దారి చూపిస్తారు.
CION ఆంకాలజిస్టులను కలవండి. మీ కుటుంబ చరిత్ర లేదా జెనెటిక్ రిపోర్ట్ను వారి దగ్గరకు తీసుకురండి.
కుటుంబంలో క్యాన్సర్ ఎక్కువగా కనిపించినవారిని మా మెడికల్ ఆంకాలజిస్టులు చూస్తారు, అవసరమైన చోట జెనెటిక్ కౌన్సెలింగ్, టెస్టింగ్ ఏర్పాటు చేస్తారు, ఆ తర్వాతి తనిఖీలను ప్లాన్ చేస్తారు.
Dr. C. Raghavendra Reddy
MBBS(Gold Medal), DNB(General Medicine), DM(Medical Oncology)(Gold Medal)
Dr. Bharati Devi Gorantla
MBBS, MD(General Medicine), DM(Medical Oncology)(Adyar,Chennai), ECMO, MRCP SCE(UK)
Dr. Owais Mohammed
MBBS, MD (General Medicine), DrNB (Medical Oncology), ECMO, MRCP SCE (Medical Oncology) (UK)
మీ కేసుకు ఒక ప్రత్యేక డాక్టర్ కావాలా? బుక్ చేసేటప్పుడు వారి పేరు చెప్పండి.
ఉచిత కన్సల్టేషన్ బుక్ చేయండిమా స్పెషలిస్ట్ తో అపాయింట్మెంట్ బుక్ చేయండి
మీ పేరు, ఫోన్ నంబర్ ఇవ్వండి — 30 నిమిషాల్లో మేమే కాల్ చేసి మీ కన్సల్టేషన్ టైమ్ ఫిక్స్ చేస్తాం.
ఆధారాలు
- GeneReviews (NCBI) — Lynch Syndrome
- MedlinePlus Genetics — PMS2 gene
- Human Mutation — Clinical analysis of PMS2: mutation detection and avoidance of pseudogenes
- Frontiers in Oncology — Evaluation of pathogenic variants detected in high homology regions of the PMS2 gene. How effective is long-range PCR?
ఈ పేజీ సాధారణ సమాచారం మాత్రమే, ప్రిస్క్రిప్షన్ కాదు. ఇక్కడ చదివినదాని ఆధారంగా ఏ చికిత్సనూ మార్చకండి లేదా ఆపకండి. ఏదైనా ఆందోళనగా ఉంటే మీ చికిత్స బృందాన్ని సంప్రదించండి — లేదా మా హెల్ప్లైన్కు కాల్ చేయండి, సరైన స్పెషలిస్ట్ను చేరుకోవడానికి సహాయం చేస్తాం.
ఇంకా చదవండి
సంబంధిత పేజీలు
మాతో మాట్లాడండి
మీ PMS2 రిపోర్ట్లో ఫలితం తేలలేదని ఉందా?
రిపోర్ట్లో ఏమి ఉందో, బంధువు కణితికి స్టెయిన్ టెస్ట్ జరిగిందో లేదో మాకు చెప్పండి. తర్వాతి టెస్ట్ను ప్లాన్ చేయగల కౌన్సెలర్ను చేరుకోవడంలో సహాయం చేస్తాం. అన్ని CION కేంద్రాలకూ ఒకే హెల్ప్లైన్.